Story Mega Man Zero 4

PAL Packshot von Mega Man Zero 4 für den Game Boy Advance

In Mega Man Zero 4 hat Dr. Weil die Führung über Neo-Arcadia übernommen. Seitdem herrscht dort Chaos und Unterdrückung. Einige Menschen versuchen versuchen zu fliehen. Ihr Ziel ist die Absturzstelle der Eurasia-Kolonie, Area Zero. Dort soll ein noch intaktes Öko-System bestehen, unabhängig von Neo-Arcardia. Als Dr. Weil davon erfährt leitet er seinen "Ragnarok" Plan ein und schickt seine acht Einherjars nach Area Zero, um den letzten Zufluchtsort der "freien" Menschen zu vernichten.

Jüngst versucht ein Konvoi, unter der Leitung von Neige nach Area Zero vorzudringen, allerdings werden sie auf dem Weg von Weils Drohnen überfallen. Im richtigen Moment taucht Zero auf und macht kurzen Prozess. Nach einem kurzen Gespräch mit Neige entschließen sich Ciel und Zero zu helfen. Allerdings sind die dortigen Menschen gegenüber Reploids sehr misstrauisch.